3 歲以下兒童并非必須抽血鑒定，可優先選擇無創、低痛感的樣本類型。
目前主流做法是采集口腔拭子：用無菌拭子在兒童口腔內側頰部輕輕旋轉 15-20 次，每人采集 3 根，過程無創傷、無痛苦，且 DNA 提取成功率與血液樣本相當（可達 99% 以上）。若兒童配合度低，也可采集帶毛囊的頭發（5-10 根）或指甲（需含甲床，10 片左右），這些樣本同樣能滿足檢測需求。僅在特殊情況（如口腔黏膜疾病導致無法采集拭子、樣本污染需二次采樣）下，才會考慮采集微量血液（如足跟血、指尖血，僅需 0.5ml 左右），且會由專業醫護人員操作，盡量減少兒童不適。
