除了DNA鑒定，還可以通過以下幾種方法進行親子鑒定：
血型鑒定：根據紅細胞ABO血型系統和Rh血型系統進行鑒定。例如，如果父親為RH陰性血，則孩子也是RH陰性血的概率較大；若父親為RH陽性血，則母親必然是RH陽性血，所以孩子的血型只能是RH陽性血1。
人類染色體異常克隆體檢測：需要對受試者的精子或卵子發生突變產生異常克隆體的情況加以判斷，從而推斷親緣關系。具體而言就是將受精卵培養至顯微鏡下觀察分裂中期的染色體，如出現兩個X染色體則可確認其母系來源，即為親緣關系鑒定提供依據1。
DNA指紋：指具有完全個體特異的DNA多態性，其個體識別能力足以與手指指紋相媲美，因而得名。可用來進行個人識別及親權鑒定，同人體DNA的酶切片段雜交，獲得了由多個位點上的等位基因組成的長度不等的雜交帶圖紋，這種圖紋極少有兩個人完全相同，故稱為DNA指紋2。
STR檢測（短串聯重復序列）：又稱微衛星DNA，是一類廣泛存在于人類基因組中的DNA多態性基因座。它由2~6堿基對構成心序列，呈串聯重復排列。STR基因位點長度一般在100～300bp之間。因其基因片段短、擴增效率高、準確等特點，被稱作第二代DNA指紋，近幾年親子鑒定多采用該方法2。
SNP：成為代遺傳標志，人體許多表型差異、對或疾的易感性等等都可能與snp有關2。
RFLP分析：限制圖譜標記和可見表型重組頻率是可測量的，將遺傳圖譜分為基因型和表型兩種分子標記。限制標記成為分子水平上測定遺傳基因的有力工具，也是因為它不受對表型有影響的基因組變化。RFLP和SNP是連鎖圖譜的基礎，對于親子鑒定具有重要的意義
需要注意的是，以上提到的方法都有其局限性，可能無法像DNA鑒定那樣提供高準確性的結果。此外，這些方法也可能受到各種因素的影響，如樣本質量、實驗技術、數據分析等。因此，在實際應用中，建議選擇正規的鑒定機構進行DNA親子鑒定，以確保結果的準確性和可靠性。
二、 仍在特定情況下使用的輔助方法這些方法不能作為親子關系的直接證據，但可以作為佐證或用于其他目的的年代推斷。
出生時間推斷
女性的排卵期可能提前或推后，受孕日期本身就是一個估算值。
這只能證明“有可能”，是間接證據，無法直接證明生物學關系。
原理：通過核對母親的受孕時間、妊娠時間和分娩日期，來判斷被懷疑的男性在關鍵時間點是否有可能與母親在一起。
缺點：
現狀：在法律訴訟中可作為輔助的時間線證據，但不能作為決定性證據。
三、 現代DNA技術的不同形式當您說“除了DNA”時，可能特指需要抽血或特殊采集的DNA測試。但實際上，現代DNA鑒定技術本身也非常多樣化：
常規樣本DNA鑒定：使用血液、口腔拭子（用棉簽刮取口腔黏膜細胞）等。這是標準的方式。
特殊樣本DNA鑒定：技術的發展使得即使沒有血液也能進行DNA檢測，準確率同樣，包括：
帶毛囊的頭發（必須是拔下來的，剪下來的不行）
指甲
用過的牙刷、口香糖、煙頭
精斑、血跡（在法醫學中常用）
胎兒親子鑒定：通過孕婦靜脈血（無創產前親子鑒定）或羊水穿刺、絨毛膜穿刺來獲取胎兒的DNA信息與疑父對比。
