種蛋從貯藏室取出后，要在孵化室內自然預熱，待蛋表溫度達到室溫后即進行碼盤入孵，碼盤位置與貯存時一致。另外，孵化機事先清洗、、調試，并要預熱。
翻蛋
在入孵后第1～20天，每隔2～3小時要翻蛋一次，每日翻蛋8～12次，翻轉角度為90度，以使胚胎各部分受熱均勻，防止胚胎黏殼。如果孵化機內各處溫差±0.5℃，則每日要調盤一次，即上下蛋盤對調，蛋盤四周與中央的蛋對調，以彌補溫差的影響。
孵化溫度和濕度的要求
如果把孵化機傳感器放在孵化機內蛋盤外面的空間里，在入孵后第1～7天孵化機空間溫度為38.5℃，第8～18天為38℃，第19～21天為37.5℃，如果把孵化機傳感器放在蛋盤里的種蛋上，則從始至終保持蛋溫37.8～38度即可。孵化濕度根據孵化機不同而區別，電熱管直接放在孵化機內加溫的老式孵化機，機內風很大,入孵后第1～20天孵化濕度60%,第21～24天為70%。用暖風加熱，機內風機較小的孵化機，入孵后第1～20天孵化濕度45%，第21～24天為60%。
照蛋
第1次照蛋在孵化后第7天進行，通過照蛋，撿出無精蛋和死胚蛋。受精蛋胚胎發育正常，血管呈放射狀分布，顏色鮮艷發紅；死胚蛋顏色較淺，內有不規則的血環、血弧，無放射狀血管；無精蛋發亮無血管網，只能看到蛋黃的影子。第2次照蛋在入孵后第17天進行，以刪除死胚蛋，活的正常胚蛋移入出雛盤和出雛器?；钆叩俺屎诩t色、邊界彎曲、氣室傾斜、周圍有粗大的血管；死胚蛋氣室周圍看不到暗紅色的血管，邊緣模糊，有的蛋顏色較淺，小頭發亮。在孵化過程不定期地抽檢胚蛋，以便掌握胚胎發育情況，并據此采取相應措施。
孵化管理
雞蛋在孵化期間，每日定時觀察溫度和濕度（如不符合要求應及時調整），并做記錄，一般每2小時檢查記錄一次。定時往孵化機的水盤內加水，定時翻蛋。注意通風換氣及儀表、指示器的變化，如有異常應及時排除故障。
落盤與出雛
雞種蛋孵化至18天，應將活的胚蛋落盤。落盤后要按種蛋孵化的溫度與濕度要求來控制溫度和濕度，即較前一孵化階段，溫度適當降低，而濕度適當增加，以利出雛。為保證有足夠濕度，應適當增加水盤數量，保持水盤內的清潔，以利水分蒸發。雞種蛋孵化至第20天即開始出雛，滿21天出雛完畢，雞雛出殼后，在出雛器內要停留至羽毛干透，而后取出，放入育雛室或箱中。揀雛過早，幼雛羽毛未干，對環境適應性差；撿雛過晚，幼雛羽毛干后，即可活動，則雛可能自行爬出，掉入水盤淹死。出雛期間應盡量少開照明燈，只在撿雛時開燈，以免幼雛爬行時損傷關節。一般2小時揀雛一次。
每次孵化工作結束后，應將孵化器、出雛器及用具進行徹底清掃、刷洗和。
