檔案盒的材料選擇至關重要，因為它直接影響到檔案的保存期限。市面上的檔案盒大致分為塑料（PP）和紙質兩類。
塑料檔案盒雖然耐磨、防潮，但它們會隨著時間的推移而老化變脆，因此不適合長期保存檔案。
紙張的敵人就是酸。酸性越大，紙張的脆性越大，使用壽命也就越短。更糟糕的是，紙內的酸還會遷移到與之接觸的其他紙張上，導致原本不帶酸性的紙張也受到影響，從而縮短保存壽命。
無酸紙（acid free paper）是一種不含活性酸的紙張，接近中性，pH值為7.0或更高。它采用國際上先進的AKD中性施膠工藝，無酸腐蝕，用其制成的檔案盒可以使檔案長期保存、不變質、不褪色，還能防蟲、防霉。無酸紙檔案盒的使用壽命可以長達兩百年，因此，檔案室多采用無酸紙質檔案盒。
購買無酸紙檔案盒時，需要注意以下幾點：
檔案盒的生產應參照國標GB/T 9705-88，而國家檔案局推薦的檔案盒用無酸紙為國產WSD-S200031及WSD-J9718無酸紙，購買時產品上有以上標注。
無酸紙檔案盒通常采用680克重的紙張制作（340克紙雙裱），低于此值的紙張慎購。
選擇合適的檔案盒對于保護珍貴檔案至關重要，無酸紙檔案盒無疑是更好的選擇。
