根據《認定辦法》和《工作指引》相關規定，優化申報流程，精簡申報材料，完善工作機制，具體程序如下：

1.自我評價。企業對照《認定辦法》第十一條和《工作指引》第三部分進行自我評價。自評符合條件的，可按照本通知要求準備申報材料。

2.注冊填報。申報企業登錄“科學技術部政務服務平臺”實名認證通過后開展后續申報工作。已注冊企業無需重新注冊，可用原用戶名和密碼登錄系統進行申報。

3.網上提交。企業在“科學技術部政務服務平臺”，按系統要求填寫認定申報信息、逐一上傳附件材料（作為評審依據，附件材料須清晰、完整、規范），并及時通過網絡系統提交，完成網上填報。

4.紙質材料提交。企業通過“科學技術部政務服務平臺”生成并打印《高新技術企業認定申請書》，并提供相關附件材料。附件材料須與申請書所填內容一致，并本著“與認定條件緊密相關”的原則，盡量簡明扼要，申報材料內容及要求見附件3。按照屬地原則，國家高新區外企業將紙質材料（一式一份）提交至所在市科技局審核留存，國家高新區（含黃三角農高區）內企業將紙質材料（一式一份）提交至所在高新區科技部門審核留存。對涉密企業，應按照國家有關保密工作規定，將申報材料做脫密處理，確保涉密信息。

5.材料審核。各地科技部門收到企業申報材料后，要按要求對申報材料中知識產權、近三年項目研發活動和成果轉化情況、2021年度的科技活動人員和高新技術產品（服務）情況、研發組織管理水平等內容的真實性、合規性進行認真審核把關，客觀記錄核查中發現的問題，填寫好《高新技術企業認定申報核實意見表》。各地科技部門切實做好審查工作，強化責任意識，把好審核關，杜絕審核流于形式、走過場，對現場核查中發現與申報材料不一致、有弄虛作假行為或不符合申報要求等情況的企業一律不得推薦上報。

6.匯總推薦。各市科技局（國家高新區）完成材料審核后，在系統提交推薦企業認定申報材料，并正式行文出具推薦函、推薦匯總表、中介機構審核匯總表（各一式四份）、中介機構PDF版證明材料以及企業認定申報資料電子版（一式兩份）報送省科技廳，推薦函、推薦匯總表同時抄送同級財政和稅務部門，企業認定申報資料電子版報市稅務局一份。