分類指的是檔案歸類，即將完成組件（卷）的檔案按照分類方案劃分、歸入相應的層次和類別，揭示檔案內在聯系，使檔案形成一套有機體系。
文書檔案一般采用年度、機構（問題）、保管期限分類項進行復式分類，如：年度—機構（問題）—保管期限、年度—保管期限—機構（問題）、年度—保管期限等。規模較大或公文辦理程序適于機構（問題）分類的立檔單位，一般采用年度—機構（問題）—保管期限、年度—保管期限—機構（問題）三級分類；規模較小或公文辦理程序不適于按機構（問題）分類的立檔單位，可采用兩級分類，如：年度—保管期限分類法。
照片、錄音、錄像、實物檔案分類方法與文書檔案類似，但一般按照問題進行分類較為適宜，即照片、錄音、錄像檔案按照問題或事由分類，實物檔案按印章、題詞、獎牌、獎章、證書、公務禮品等問題分類。檔案數量較少的，也可以不分問題，采用兩級分類。常見的分類方法包括：年度—問題—保管期限、年度—保管期限—問題、年度—保管期限等。
