中央空調停運后，冷卻水系統和冷凍水系統的清洗可用采取單臺設備清洗方式或全系統清洗方式。但無論是單臺設備清洗還是全系統清洗，一般都使用清洗槽和清洗泵將單臺設務或原系統(可使用原系統的水泵)構成一個閉合回路進行循環清洗。
清洗一般按下列程序進行。滅藻清洗、堿洗、封存、(中)鈍化、堿洗后水沖洗、運行、(中和)預膜、酸洗、漂洗、酸洗后水沖洗、水沖洗(檢漏)
盡量每月開次機：
注意經常檢查空調器電源插頭與插座是否接觸良好、無松動或脫落，通風道是否阻塞，空調運行時聲響是否正常。在不使用空調的季節，也要保持一個月開機一次的使用量。空調的工作核心是壓縮機，如果長時間不使用，壓縮機內潤滑油可能會凝結，影響下一次的使用。
使用季結束后清洗：
中央空調應對季節性停機時，建議做好清洗工作。清洗中央空調過濾網時，將過濾網抽出來，用吸塵器把上面的塵土吸干凈，也可以用清水沖洗干凈。晾干后裝入空調使用。對塵土較多的環境，過濾網應該經常清洗，以免灰塵太多堵死出風口，而影響制冷效果。清洗好后只開空調器的風機，運轉約2至3小時，使空調器內部干燥，祛除濕氣。
環境溫度過高：壓縮機應用相關手冊中給出的要求是環境溫度不超過40℃，因此在予以應用的時候就需要首先確認環境溫度是否符合這樣一個要求。一旦環境溫度過高，就立即停機，以此來避免更大的損失發生；除此之外，還需要檢查工作環境的通風狀況以及冷卻狀況是否良好。通過這樣一系列的檢查、處理和保障，基本上就能夠保障壓縮機工作環境的溫度符合要求。
軸承的損壞：如果振動感應器所感應到的振動是發生在軸承的附近，則可能的原因就是供油不足或者是存在著雜質，這樣一些情況都有可能導致軸承磨損和振動的發生，這樣一種情況發生以后就需要盡快的更換軸承。
