北京同仁醫院擁有教育部重點實驗室1個，工信部重點實驗室1個，北京市重點實驗室5個;工程研究中心1個，省部級工程研究中心4個;省部級國家科技合作基地2個，北京實驗室1個。醫院是全國防盲技術指導組和防聾治聾技術指導組組長單位，設有世界衛生組織防盲合作中心和世界衛生組織防聾合作中心，作為國際眼庫協會會員單位，設有北京同仁眼庫。
北京同仁醫院眼底科引領國內眼底病治 療的發展方向，在國內率先開展了間接檢眼鏡下孔源性視網膜脫離的手術治 療，蕞早開展了玻璃體視網膜顯微手術，創新了視網膜中央動脈栓塞的玻璃體手術治 療，在驅逐性出血以及眼底腫瘤的放射性敷貼治 療和局部切除手術治 療等多個方面處于國內和國際前沿。
在臨床相關研究方面，北京同仁醫院眼底科開展了增生性玻璃體視網膜病變發病機制的研究，視網膜下人工假體植入技術及組織相容性研究，高度近視眼致病基因定位及蛋白質組學分析，黃斑營養不良的致病基因定位研究，年齡相關性黃斑變性發病危險因素和早期干預研究，以及眼病的流行病學研究等。持續不斷的獲得了多項及省部級課題經費的支持。發表了系列高質量研究論文，形成了同仁品牌效應和國際影響力。
北京同仁醫院眼底科現已發展成為我國規模大、技術力量強的眼底病手術專科。多年來在國內始終保持黃斑疾病手術量首 位。在黃斑部疾病、各種視網膜脫離、糖尿病視網膜病變、高度近視眼底病變、早產兒視網膜病變、眼內腫瘤等主要眼底疾病的診治水平均處于國際先 進水平。
