北京兒童醫院精神科目前已開設如下專業細分門診：注意缺陷多動門診、孤獨多動抽動門診、學習困難門診、心理咨詢門診、青春期心理咨詢門診、精神病專病門診、精神殘疾評估門診、腦功能及行為發育門診、腦認知功能評估門診、心身會診聯絡門診等。
北京兒童醫院精神科主任醫師陸小彥，主要從事兒內科及感染性疾病的臨床和教學工作，歷任總住院醫師，主治醫師，副主任醫師，住院病區主任等。1999年在北京大學第六醫院專修兒童心理及精神?？?，掌握兒童精神疾病的診斷和原則，同年創辦兒童醫院心理門診;2001年在中國科學院心理所醫學心理咨詢與專業學習，并于2003年研究生班畢業、獲心理測量及心理從業資格證書;2004年與首都醫科大學合作，引進CES(微量生物電徑顱磁刺激)技術兒童各種疼痛、緊張、焦慮、等癥狀并取得良好效果。
北京兒童醫院積極發揮學科龍 頭作用，領航兒科行業發展。2013年牽頭組建北京兒童醫院集團，創新“病人不動、醫生移動”的模式服務全國患兒，目前理事單位成員已達57家。醫院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫療機構和科研院所建立了良好的關系和廣泛的合作，是科技部認定的兒童重大疾病國際科技合作基地。
北京兒童醫院精神科一直堅持心理健康應該從娃娃抓起。在兒童心理健康領域做了大量探索的工作，其中以腦與認知神經科學為主。先后承擔和參與了一系列重大的兒童神經發育領域的科研項目。
