胃腸腫瘤中心一病區是北京腫瘤醫院以胃癌、結腸癌和直腸癌診治為主的外科臨床科室。1976年建所初期成立的腫瘤外科腹部外科專業組即為現在胃腸腫瘤中心一病區的前身，是腫瘤研究所成立初期幾個主要病種防治研究專業之一。
胃腸腫瘤中心一病區現有病床33張，醫護人員37名，其中主任醫師4人，副主任醫師2人，主治醫師5人，住院醫師8人，護士18 人。學科帶頭人季加孚教授，科室副主任李子禹教授，任暉任護士長。
醫療特長及優勢：以患者的個體化為宗旨，積極推廣胃腸腫瘤的規范化手術，重視綜合，提倡人性化服務。胃癌的標準D2根治手術、圍手術期綜合、胃腸道腫瘤微創手術、胃腸道腫瘤的腹腔鏡探查術、胃癌手術中的納米碳淋巴結示蹤技術、早期胃癌的EMR/ESD內鏡下、腹腔熱灌注化療及直腸癌的術前放療等已成為科室特色的常規手段。
現科室年門診量近13000人，病房年收治患者近1300人，手術量近800臺。其中胃癌患者約占2/3，結直腸癌患者約占1/3。規范細致的手術操作、合理的綜合、豐富的病例管理經驗和人性化的護理是患者療效為可靠的保障。
乳腺癌預防中心提供乳腺腫瘤診斷及方面的醫療服務。本中心于1998年在北京市重點學科專項資助下組建。2004年結構調整，成為具備乳腺腫瘤診治功能的一級臨床科室，功能涵蓋乳腺癌篩查，乳腺病變的診斷，原發性乳腺癌、隨訪及康復指導，復發性乳腺癌，同時開展相關臨床與基礎研究。
2021年科室醫生總人數30人，正高職稱人數6人，副高職稱人數8人，中級職稱人數13人，初級師人數3人。按學歷劃分：博士21人，碩士4人，本科4人，專科1人。科室主任：歐陽濤，副主任：范照青、何英劍。護士長：于新穎、徐京燕、孫紅娟。
本中心由門診診室4間、住院床位64張、門診穿刺室、超聲影像診斷室等部分組成。
“依據循證醫學原則，結合研究成果，提供規范的、專業化的醫療服務，保障乳腺腫瘤的總體療效”是“中心”的任務，“提供高品質的醫療服務，做出有指導意義的研究成果”是“中心”團隊追求的目標。
消化腫瘤內科專注于胃腸道腫瘤的，以臨床研究推進臨床實踐，以人才培養帶動學科發展。專長于胃癌、結直腸癌、食管癌、胰腺癌、胃腸間質瘤、神經內分泌腫瘤、膽道腫瘤、肝癌等，以及難治性消化系統腫瘤的診斷與、綜合及個體化。消化腫瘤內科擁有60多張病床，2013年接診3萬余人次。患者來自全國各地以及海外。科室專業技術實力雄厚，特別在胃癌、食管癌等中國高發腫瘤以及結直腸癌的，我們積累了豐富的經驗，水平居于國內地位，病人在這里能享受到的醫療服務、的策略與方案。我們還為國內各大腫瘤專科醫院培養了數百人的研究生及進修醫生，推動了國內消化道腫瘤的規范化。同時我們基于臨床問題開展的臨床研究，以及牽頭承擔的數十項國家、省市級科研項目，提升了國內整個臨床水平，促進了學科發展。
北京大學腫瘤醫院介入科創建于1996年，是一個獨立的、有鮮明特色的臨床科室。目前介入病房有34張床位，醫師13人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱5人，中級職稱4人，住院醫師3人，在讀研究生4人。科室配備了GE大平板血管造影系統(4100IQ)，具有大視野DSA功能、三維血管成像和CBCT成像功能，三維血管容積成像使經血管的腫瘤介入準確性和性明顯提高，同時完成的CT斷層重建使經皮穿刺介入功能進一步完善。目前正在安裝配置國際Siemens Miyabi Angio-CT系統，該系統具有滑動64層螺旋CT功能和大平板數字化減影功能，并實現CT和DSA的真正融合，是現代影像學引導介入的典范，推動該科的介入達到國際先進水平。
