北京兒童醫院兒童保健中心成立于七十年代，2000年6月1日正式由保健科更名為兒童保健中心。中心擁有一支雄厚的專業隊伍、完整的兒童保健服務內容和流暢的檢測程序，是一家集掛號、繳費、檢測和診療于一體的兒童保健機構。

北京兒童醫院保健中心還承擔著首都醫科大學兒科系學生兒童保健部分的教學工作。并曾多次承擔世界衛生組織、兒基會以及國際多中心合作等項目工作。

國家兒童醫學中心、首都醫科大學附屬北京兒童醫院是集醫療、科研、教學、保健于一體的三級甲等綜合性兒科醫院，前身是我國現代兒科學奠基人諸福棠院士于1942年創辦的北平私立兒童醫院。醫院總占地面積7萬平方米，建筑面積12萬平方米，編制病床970張，年均門診量約300萬人次，住院病人8萬余人次，手術逾2.6萬例。

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