科學研究發現，在孕婦的外周血中存在著一定比例的胎兒游離 DNA，從懷孕6周開始就可以檢測到，并且胎兒中的比例隨著孕婦周增加。利用新一代DNA測序技術對母體外周血中的游離DNA片段進行測序和生物信息分析，從中可得到胎兒的遺傳信息。這些信息已經成功應用于胎兒染色體疾病（如21三體）的無創檢測。

2.基于SNP的遺傳分析

單核苷酸多態（SNP）是基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。SNP在人類基因組分部廣泛，據估算至少有300萬個。由于SNP含量豐富、具有較高的遺傳穩定性，被認為是繼STR后的第三代遺傳標記。SNP已廣泛應用于醫學遺傳學、群體遺傳學和基因組學等方面的研究，在法醫物證方面的應用也正在興起。

3.親子鑒定基本原理

每個人都有兩套遺傳信息，一套來自父親，一套來自母親。每個基因座上的兩個等位基因也分別來自父親和母親。確定孩子的一個等位基因來自母親后，另一個等位基因就必然來自其生父（生父基因）。疑似父親并不帶有這個生父基因的情況下，就可以排除他是孩子的生父。檢查的遺傳標記越多，非生物學父親被排除的概率也就越大。

4.父權指數和父權概率

父權指數（PI）是親子關系鑒定中判斷遺傳證據強度的指標。它是判斷親子關系所需的兩個條件概率的似然比，即具有疑似父親基因型的男性是孩子生物學父親的概率（X）與隨機男子是孩子生物學父親的概率（Y）的比值，即PI=X/Y。多個遺傳標記用于親子鑒定時，單獨計算每一個遺傳標記的父權指數（PI1，PI2，PI3，…，PIn）,n個遺傳標記父權指數相乘即為累計父權指數（CPI）。

父權概率（RCP）是親子鑒定結果的另一種表達方式，它表示在母、子、疑似父親的遺傳標記檢測結果的條件下，疑似父親的確是孩子生父的概率，RCP=CPI/（CPI+1）。

被檢測男性的CPI小于0.0001時，排除被測男性是孩子的生物學父親（RCP<0.01%）；反之，CPI大于10000時，支持被測男性是孩子的生物學父親（RCP>99.99%）。