土壤有機質由土壤中未分解的、半分解的有機物質殘體和腐殖質組成。施入土壤中的新鮮有機肥料，在微生物作用下，分解轉化成簡單的化合物，同時經過生物化學的作用，又重新組合成新的、更為復雜的、比較穩定的土壤特有的大分子高聚有機化合物，為黑色或棕色的有機膠體，即腐殖質。腐殖質是土壤中穩定的有機質，對土壤肥力有重要影響。,生物肥能有效利用土壤中的營養元素，提高作物產量，減少肥料施用量，提高肥料利用率。,土壤有機質是衡量肥力水平的主要標志之一，是土壤肥力的物質基礎，是補給和更新土壤有機質的物質來源。,有機肥料進人土壤后，經微生物分解，縮合成新的腐殖質，它能與土壤中的粘土及鈣離子結合，形成有機無機復合體，促進土壤中水穩性團粒結構的形成，從而可以協調土壤中水、肥、氣、熱的矛盾。,在使用有機肥之前，經過發酵處理。由于許多有機肥料帶有病菌、蟲卵和雜草種子，這些不利于作物的健康生長，所以要經過加工處理后才能施用。,有機肥養分釋放均勻長久有機肥料所含的養分多以有機態形式存在，通過微生物分解轉變成為植物可利用的形態，養分可緩慢釋放，長久供應作物。比較而言化肥所含養分均為態，施入土壤后，肥效快，但有效供應時間短。,中國農業科學院土壤肥料研究所的研究表明，不合理、過多地追施氮肥，蔬菜體內的硝酸鹽含量明顯增加，特別是白菜、菠菜和生菜可食部分，硝酸鹽高達1000μg/g，高者可達1700μg/g，而廄肥區僅為200～500μg/g，低僅幾十個μg/g。對于西紅柿和菜花類，采用有機無機肥配合，可使維生素C的含量提高16.6～20.0μg/g。