2001年6月10日，公司整體變更設立為股份公司，公司正式更名為“農夫山泉股份有限公司”。

2002年，全球市場研究機構——AC尼爾森：中國消費品市場中的六大品牌，“農夫山泉”是民族品牌。

1997年至2003年，公司相繼在國家一級水資源保護區千島湖、吉林長白山礦泉水保護區、湖北丹江口建成現代化的飲用水及果汁飲料生產工廠。

2003年春季，公司推出“農夫果園”混合果汁飲料，在上市之初即被業界稱為“搖出了果汁行業的新天地”。“農夫果園”的上市，標志著公司從單一的飲用水公司跨入綜合飲料開發深加工企業的行列。

2003年9月，“農夫山泉”瓶裝飲用天然水被國家質檢總局評為“中國產

品”

2003年10月，公司贊助1000萬元支持中國航天事業。成為中國載人航天工程贊助商，農夫山泉飲用天然水成為中國航天員專用飲用水。

2004年，公司推出全新功能性飲料——“尖叫”。

2004年初，公司取得國家質檢總局頒發的全國工業產品生產許可證，成為飲料行業首批取得食品質量市場準入認證的企業之一。公司在廣東河源市萬綠湖投資建設中國的飲用水基地、華南的景點式旅游工廠。

2006年10月17日，國家工商總局商標局認定“農夫山泉”為商標。